母亲血液中的病毒抗体也会透过胎盘或因分娩时污染而进入婴儿体内，表现为乙肝五项中的第四项（e抗体）和第五项阳性（核心抗体）阳性。但这些指标的阳性并不代表孩子已经被妈妈感染。通过出生后立即注射乙肝免疫球蛋白，接种乙肝疫苗，这些污染到宝宝体内的病毒在没有感染肝细胞以前大部分在半年内可以被清除，极个别甚至到1岁半被清除。但也有少数孩子出生时已经发生宫内感染，或免疫失败病毒没有清除而被感染。

所以，孩子出生不久血液内检测到病毒不足为奇，一般确定孩子是否被母亲感染要在孩子注射完第三针乙肝疫苗后（出生7～12个月）检查，才能基本确定。如果孩子出生7～12个月检查，血中仍有乙肝病毒的第一项（表面抗原）和/或第三项阳性（e抗原），或者检查到血中HBVDNA阳性，才能基本确定母婴阻断失败。一般太小的孩子不建议盲目治疗，以免影响孩子的发育。